در ابتدای فصل باشگاه پرسپولیس به یک‌باره از تمدید قرارداد کریم باقری صرف نظر کرد که این کمی عجیب بود! خیلی‌ها یکی از دلایل ناکامی تیم پرسپولیس در فصل جاری را به عدم حضور کریم باقری در کادر فنی ربط می‌دهند. باشگاه پرسپولیس در این باره هیچ توضیحی نداد و کریم باقری هم نشان داد، اصلا تمایلی ندارد در این باره صحبت کند.
اما بعد از ماه‌ها کریم باقری در مصاحبه با پژمان جمشیدی راز جدایی‌اش را از کادر فنی تیم پرسپولیس توضیح داد. او گفته که دوستان به باشگاه گفته‌اند که من امسال در کنار تیم نباشم! منظور کریم باقری این بود که نبودن او در کادر فنی باشگاه پرسپولیس یک دستور بود که از مدیران بالادستی به باشگاه ابلاغ شد.
رضا درویش مدیر عامل باشگاه پرسپولیس فعلا به ادعای کریم باقری واکنشی نشان نداده است و به نظر می‌رسد واکنشی نشان نخواهد داد. چون تایید و عدم تایید این خبر می‌تواند تبعاتی برای او به همراه داشته باشد.
